Заповедник расположен в Приморском крае, на площади 64316,3 га, из которых 63,0 га акватории. Территориально заповедник разбит на четыре участка: Южный, Западный, Восточный и Северный.
Широта: 42°29’40’’ 42°38’50’’ 42°35’85” 42°56’15”
Долгота: 130°57’00” 131°21’40” 130°51’41” 131°43’33”
Благодаря уникальным природным условиям и контрастному климату острова заповедника, которых насчитывается более 30, отличаются исключительным разнообразием: здесь есть субтропические леса и голые скалы, песчаные пляжи и степи, тайга и болота.
На островах устраивают гнездовья птицы, 390 видов. Из них 22 занесено в Красную Книгу России. Здесь живет колония пестроголового буревестника, вилохвостая качурка, очковые чистики и тонкоклювые кайры. Останавливаются перелетные птицы: буревестник, розовая чайка, орланы и поморник. На сопке Сюдар уютно устроились тысячи змей.
Встречаются на островах и экзотические животные:
- Желтоклювая цапля;
- Саргассовый морской клоун;
- Морская свинья.
Воды залива чистые и прозрачные удивительного зеленовато-желтого, местами зеленовато-голубого цвета. Растет в них 170 видов водорослей, живет 2000 особей беспозвоночных, морские ежи, осьминоги, морские звезды, трепанги, гребешки и 277 видов рыб.
На островах 414 разновидностей растений.Только здесь растут такие редкие растения как девичий виноград, зубчатый дуб, железная береза и др. Гордость заповедника — тисовая роща, которой 1200 лет (о. Попова), кедры, ели, грабы, липы, корейская сосна, орхидеи и т.д.
На о. Попова находится музей “Природа моря и ее охрана”, археолого — этнический комплекс “Наследие”. Есть гостиница, столовая, магазины.
Попасть на остров можно из г. Владивостока на пароме, предварительно оформив разрешение. Южный и Восточный участки возможно посетить только через турфирмы.